金鉆腳輪電泳技術(shù)
發(fā)表時(shí)間:2020/9/18 9:43:17
五種金鉆腳輪電泳技術(shù)的比較
SDSPAGE
名詞解釋:
相對(duì)遷移率(Rf)
問答題:
1.簡(jiǎn)述SDS-PAGE的基本原理。
2.影響SDS金鉆腳輪電泳的關(guān)鍵因素有哪些? AGE
名詞解釋
1.遷移率
2.電滲
3.金鉆腳輪電泳
問答題
1.影響金鉆腳輪電泳遷移率的因素有哪些?
2.試述瓊脂糖凝膠金鉆腳輪電泳分離脂蛋白的原理。 CAME
1.CAME的基本原理是什么?
2.CAME分離血清蛋白金鉆腳輪電泳時(shí)應(yīng)注意哪些問題? PAGE
名詞解釋
1.凝膠總濃度
2.交聯(lián)度
問答題
1.與CAME相比,PAGE有哪些特點(diǎn)。
2.試比較CAME與PAGE操作的區(qū)別。
3.簡(jiǎn)述不連續(xù)PAGE的原理。
1.瓊脂糖凝膠金鉆腳輪電泳Agarose Gel Electrophoresis
Gel Electrophoresis :由瓊脂、瓊脂糖、淀粉膠及聚丙烯酰胺等物質(zhì)作支持體的金鉆腳輪電泳。
特點(diǎn)(characteristic):
1.可以制成非常均勻的凝膠,帶電質(zhì)點(diǎn)在凝膠的孔中泳動(dòng)。
2. 金鉆腳輪電泳操作方法簡(jiǎn)便,金鉆腳輪電泳速度快。
3. 分辨率高,重復(fù)性好,金鉆腳輪電泳圖譜清晰。
4. 適用于生化,免疫等定性定量測(cè)定。
(一)優(yōu)點(diǎn)(advantage)
1.因不含硫酸根和羧基,幾乎消除了瓊脂的電滲。
2.對(duì)蛋白質(zhì)吸附極微,故無拖尾現(xiàn)象。
3.凝膠結(jié)構(gòu)均勻,孔徑較大,可用來分離酶的復(fù)合物、核酸、病毒 等大分子物質(zhì)。
4.透明度較好,可直接或干燥成薄膜后進(jìn)行染色。
5.不吸收紫外光,可直接利用紫外光吸收法作定量測(cè)定。
6.有熱可逆性。
(二)缺點(diǎn)(disadvantage)
1.機(jī)械強(qiáng)度差,易破碎,濃度不能太低。
2.易被細(xì)菌污染,不易保存,臨用前配制。
3.瓊脂糖支持層上的區(qū)帶易于擴(kuò)散,金鉆腳輪電泳后必須立即固定染色。
4.與PAGE相比,分子篩(molecular sieve)作用小,區(qū)帶少。
應(yīng)用
1. 適用于大分子的核酸、核蛋白等的分離、鑒定及純化
2. 臨床生化檢驗(yàn)中常用于LDH、CK等同工酶的分離與檢測(cè)
3. 為不同類型的高脂蛋白血癥、冠心病等提供生化指標(biāo)
影響遷移的因素
瓊脂糖凝膠分離血漿脂蛋白
原理: 血清脂蛋白經(jīng)飽和蘇丹黑B預(yù)染后,以瓊脂糖凝膠為支持介質(zhì),在pH8.6巴比妥緩沖液中金鉆腳輪電泳,根據(jù)各脂蛋白的組成、大小、形狀分離成不同區(qū)帶。
pH 8.6 > pI ,各種脂蛋白均帶負(fù)電,金鉆腳輪電泳時(shí)由負(fù)極到正極;VLDL為圓形,受阻力小,LDL形態(tài)不規(guī)則,受阻力大,所以VLDL跑在前。
加樣槽在負(fù)極,由負(fù)極到正極分別是CM\LDL\VLDL\HDL
2.醋酸纖維薄膜金鉆腳輪電泳Cellulose acetate membrane electrophoresis,CAME
特點(diǎn):低吸附作用,低電滲作用,樣本用量少,親水性
1.Low sorption
2.Low electroosmosis
3.Small sample
4.Hydrophilic
金鉆腳輪電泳圖譜不齊
①點(diǎn)樣時(shí)血清點(diǎn)加不均勻
②薄膜局部干燥
③金鉆腳輪電泳時(shí)供給薄膜的液量不均勻或過少
④緩沖液變質(zhì)
⑤金鉆腳輪電泳時(shí)薄膜位置不正,與電流方向不平行
金鉆腳輪電泳圖譜分理不清
①點(diǎn)樣時(shí)血清點(diǎn)加不均勻
②薄膜局部干燥
③金鉆腳輪電泳時(shí)供給薄膜的液量不均勻或過少
④緩沖液變質(zhì)
⑤金鉆腳輪電泳時(shí)薄膜位置不正,與電流方向不平行
金鉆腳輪電泳速度慢
1. 濃縮效應(yīng)
1)凝膠層的不連續(xù)性
兩層凝膠T與C不同孔徑不同
濃縮膠孔徑大,分離膠孔徑小,蛋白質(zhì)在大孔徑濃縮膠中移動(dòng),受阻力小,移動(dòng)速度快。
2)緩沖液離子成分的不連續(xù)性
甘氨酸(pI=6.0)在pH8.3帶負(fù)電,朝正極移動(dòng),進(jìn)入濃縮膠(pH6.7),甘氨酸解離度()很小,有效遷移率(M )很低,移動(dòng)速度較慢,稱為慢離子。
HCl 是強(qiáng)電解質(zhì),=1,Cl-有效遷移率大,移動(dòng)速度快,稱快離子。
蛋白質(zhì)(pI<6.0)帶負(fù)電荷,有效遷移率介于兩者之間。
3)pH值的不連續(xù)性
為了控制慢離子的解離度,從而控制其有效遷移率,必須使?jié)饪s膠與分離膠之間pH值有所區(qū)別。
3.分子篩效應(yīng)與電荷效應(yīng)
進(jìn)入分離膠后,Gly-成為快離子
分離膠只有電荷效應(yīng)和分子篩效應(yīng),根據(jù)各蛋白質(zhì)所帶電荷不同、分子大小不同而分離
PAGE特點(diǎn)
1.具有分子篩效應(yīng),分辨率高
2.樣品不易擴(kuò)散,用量少,靈敏度可達(dá)10-6g
3.化學(xué)性質(zhì)穩(wěn)定,分子結(jié)構(gòu)中富含酰胺基具有穩(wěn)定的親水基團(tuán)
4.凝膠不帶電荷,消除了電滲現(xiàn)象
5.機(jī)械強(qiáng)度好,有彈性,在一定濃度范圍內(nèi)無色透明
6.網(wǎng)孔可調(diào)節(jié) 4.SDSPAGE
十二烷基硫酸鈉(sodium dodecyl sulfate,SDS,also called lauryl sulfate)
是一種陰離子去污劑(anionic detergent )。
? 作用:破壞蛋白質(zhì)分子之間以及其他物質(zhì)分子之間的非共價(jià)鍵,使蛋白質(zhì)變性
(denature)而改變?cè)械臉?gòu)象;
? 保證蛋白質(zhì)分子與SDS充分結(jié)合而形成帶負(fù)電荷的蛋白質(zhì)-SDS復(fù)合物。
原理
電流過低
供給薄膜的液量不足
緩沖液離子強(qiáng)度過高
薄膜中雜質(zhì)
白蛋白區(qū)帶中間部分不著色,染色不足
染色時(shí)間不夠、點(diǎn)樣過多
γ球蛋白向反方向移動(dòng)
電滲現(xiàn)象,可提高緩沖液液面或加大電流量以改進(jìn)
區(qū)帶一邊長一邊短呈扭曲現(xiàn)象
薄膜未緊壓在金鉆腳輪電泳槽的濾紙橋上,使薄膜接觸不良而增大了電阻。
區(qū)帶拖尾或區(qū)帶過于緊密
緩沖液離子強(qiáng)度<0.05可出現(xiàn)區(qū)帶拖尾;離子強(qiáng)度>0.075可出現(xiàn)區(qū)帶過于緊密。
血清蛋白質(zhì)醋酸纖維薄膜金鉆腳輪電泳Separate serum protein in cellulose acetate membrane electrophoresis
[原理] CAME是以醋纖膜(CAM)作支持物的一種區(qū)帶金鉆腳輪電泳技術(shù)。
將血清樣品點(diǎn)樣于醋纖膜上,在pH8.6的緩沖液中金鉆腳輪電泳時(shí),血清蛋白質(zhì)均帶負(fù)電荷移向正極。由于血清中各蛋白組分等電點(diǎn)不同而致表面凈電荷量不等,加之分子大小和形狀各異,因而金鉆腳輪電泳遷移率不同,彼此得以分離。加樣:用加樣器蘸取血清約5ul,垂直印在CAM粗糙面,點(diǎn)樣區(qū)距離邊緣約1.5cm,金鉆腳輪電泳時(shí)點(diǎn)樣面朝下。加上槽蓋平衡5分鐘后再通電。電壓10~15V/cm膜總寬。金鉆腳輪電泳40~60分鐘,泳動(dòng)距離約達(dá)3.5~4cm時(shí)即可斷電。
由負(fù)極到正極可分為五條條帶
γ β α2 α1 白蛋白
3.聚丙烯酰胺凝膠金鉆腳輪電泳Polyacrylamide Gel Electrophoresis PAGE
PAG是由丙烯酰胺(acrylamide,Acr)單體和N,N'-亞甲雙丙烯酰胺(N,N,N',N'-methylene bisacrylamide,Bis)交聯(lián)劑通過自由基( free radicals)聚合而成的一種多孔三維網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)。
過硫酸胺[(NH4)2S2O8](Ammonium persulfate,AP)作為催化劑,四甲基乙二胺(-N,N,N',N'-tetramethylethylene diamine , TEMED)為加速劑。
?TEMED量多少都會(huì)影響催化作用,須在堿性條件下聚合
-分子氧存在,聚合不完全,須去除分子氧,隔絕氧
?升高溫度能提高聚合,降低溫度能延遲聚合
PAG孔徑的大小主要由Acr和Bis這兩種單體的濃度決定。可以根據(jù)要分離物質(zhì)分子的大小,選擇合適的單體濃度。
Acr/Bis:20~40 完全透明且有彈性;
<10 很脆,易碎,不透明;
>100 糊狀不成形,易破碎
常用的標(biāo)準(zhǔn)凝膠是指濃度為7.5%的凝膠
交聯(lián)度C——Bis占單體與交聯(lián)劑總量的百分比。
C=b/(a+b)×100%
電極槽緩沖液通常為pH8.3 Tris-甘氨酸緩沖液
分離原理
(一)蛋白質(zhì)分子的解聚
樣品介質(zhì)和聚丙烯酰胺中加入離子去污劑和強(qiáng)還原劑后,蛋白質(zhì)亞基的金鉆腳輪電泳遷移率主要取決于亞基分子量的大小(molecular mass of polypeptides ),而電荷因素可以被忽略。
1、SDS
陰離子去污劑(anionic detergent )
變性劑(denaturant)
助溶性試劑
斷裂分子內(nèi)和分子間的氫鍵(hydrogen bond)
分子去折疊
破壞蛋白質(zhì)分子的二級(jí)和三級(jí)結(jié)構(gòu)
2、強(qiáng)還原劑
巰基乙醇(β-mercaptoethanal)
二硫蘇糖醇(dithiothreitol,DTT)
使半胱氨酸殘基之間的二硫鍵(disulfide bond)斷裂。
SDS和還原劑的作用:
(1)分子被解聚
(2)氨基酸側(cè)鏈與SDS充分結(jié)合形成帶負(fù)
電荷的蛋白質(zhì)-SDS膠束。
(3)蛋白質(zhì)-SDS膠束所帶的負(fù)電荷大大超
過了蛋白質(zhì)分子原有的電荷量,消除
了不同分子之間原有的電荷差異。
去污劑的選擇
無離子去污劑:Lubro W;Brij35, Tween
Triton
陽離子去污劑:cetyltrimethyl ammonium
bromide (CTAB)
cetylpyyridinium (CPC)
陰離子去污劑:SDS deoxycholate
金鉆腳輪電泳過程中的不正?,F(xiàn)象
(1)“微笑”現(xiàn)象
指示劑前沿呈現(xiàn)兩邊向上的曲線形,說明凝膠的不均勻冷卻,中間部分冷卻不好。
2)“皺眉”現(xiàn)象
由于垂直金鉆腳輪電泳槽的裝置不合適引起的,特別是當(dāng)凝膠和玻璃板組成的“三明治”底部有氣泡或靠近隔片的凝膠聚合不完全。
(3)“拖尾”現(xiàn)象
樣品溶解不佳引起。
(4)“紋理”現(xiàn)象
由于樣品中的不溶顆粒引起的。
(5)偏斜現(xiàn)象
電極放置不平行引起或加樣位置偏斜而引起
(6)帶太寬
加樣量太多或加樣孔泄漏引起
分子量測(cè)定
1、相對(duì)遷移率(relative mobility ,Rf)
Rf即用每個(gè)帶的遷移距離除以溴酚藍(lán)前沿的遷移距離得到的。
測(cè)量位置應(yīng)在蛋白帶的中央。
蛋白帶遷移距離
Rf= ————————
溴酚藍(lán)遷移距離
蛋白帶遷移距離 固定前的凝膠長度
Rf= ————————— X —————————
干燥后的凝膠長度 溴酚藍(lán)遷移距離
2、作圖
以已知蛋白質(zhì)分子量的常用對(duì)數(shù)值為縱坐標(biāo),Rf為橫坐標(biāo)繪圖
3、通過測(cè)定未知蛋白質(zhì)的Rf值,便可在標(biāo)
準(zhǔn)曲線上讀出他的分子量
5.等電聚焦金鉆腳輪電泳Isoelectric Focusing Electrophoresis, IEFE
等電聚焦金鉆腳輪電泳(IEFE)是一種利用具有pH梯度的支持介質(zhì)分離等點(diǎn)電(PI)不同的蛋白質(zhì)的金鉆腳輪電泳技術(shù)。
原理: 在金鉆腳輪電泳介質(zhì)中加入載體兩性電解質(zhì),通電后,兩性電解質(zhì)會(huì)逐漸形成一個(gè)由正極到負(fù)極遞增的pH梯度,在此體系中,不同的蛋白質(zhì)移動(dòng)并聚焦于與其等電點(diǎn)相當(dāng)?shù)膒H位置。
理想的載體兩性電解質(zhì)應(yīng)具備的特征
①化學(xué)性質(zhì)穩(wěn)定;
②分子量要小
→以便與被分離大分子物質(zhì)分離;
③各成分的pI彼此接近,并在其pI值附近有良好的緩沖能力
→梯度穩(wěn)定;
④兩性電解質(zhì)載體的數(shù)目要足夠多
→梯度平滑 ;
⑤對(duì)280nm的紫外光沒有或僅有很低的吸光度
→不影響測(cè)定。
優(yōu)點(diǎn):
分辨率高(可達(dá)0.01pH單位);
靈敏度高(最低檢出量達(dá)0.1ng);
金鉆腳輪電泳區(qū)帶狹窄;
重復(fù)性好。
缺點(diǎn):
要求用無鹽溶液,而在無鹽溶液中蛋白質(zhì)可能發(fā)生沉淀;
由于樣品中的成分會(huì)停留在其pI,不適用在pI不溶的蛋白質(zhì)。
IEFE應(yīng)用
1.分析分離制備蛋白質(zhì)、多肽
①區(qū)分人血清蛋白
②測(cè)出異常免疫球蛋白
③基因分型
④csf中寡克隆區(qū)帶的檢測(cè)
2.測(cè)定pI可鑒定蛋白質(zhì)、多肽
3.雙相金鉆腳輪電泳中,IEFE作為第一相
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